การตัดสินใจของคณะกรรมการบริหารการบินไทยในการเปลี่ยนเครื่องยนต์ที่ใช้กับเครื่องบินจากยี่ห้อยีอีมาเป็นแพร็ต แอนด์วิทนี่ย์ เป็นการเปลี่ยนแปลงครั้งสำคัญอีกครั้งหนึ่งของการบินไทย

การบินไทยใช้เครื่องยนต์ของยีอีเพียงรายเดียวมาตลอดระยะเวลา 14 ปี จนกลายเป็นลูกค้าอันดับ 4 ของยีอี พลเอกวรนาถ อภิจารีผู้บัญชาการทหารอากาศและประธานการบินไทยเปิดเผยสาเหตุของการเปลี่ยนแปลงว่า เพื่อสนองตอบนโยบายของรัฐบาลที่ไม่ต้องการให้การบินไทยผูกติดกับยีอีเพียงเจ้าเดียวต่อไป

กร ทัพพะรังสี รัฐมนตรีประจำสำนักนายกรัฐมนตรีได้เรียกการบินไทยไปรับทราบนโยบายนี้เมื่อเดือนพฤษภาคม

เครื่องบินที่การบินไทยจะเปลี่ยนไปใช้เครื่องแพร็ต แอนด์ วิทนี่ย์ ในระยะแรกนี้คือเครื่องเอ็มดี 11 จำนวน 4 ลำ ทีกำหนดส่งมอบตั้งแต่เดือนตุลาคม 2533 ถึงเดือนพฤศจิกายน 2534 ใช้เครื่องยนต์ 12 เครื่องและเครื่องสำรองอีก 5 เครื่อง รวมทั้งเครื่องแอร์บัส 3 ลำ หรือ 8 เครื่องที่จะส่งมอบต้นปี 2534 มูลค่ารวมทั้งอะไหล่ประมาณ 250 ล้านเหรียญสหรัฐ

การเปลี่ยนแปลงครั้งนี้มีแรงต้านพอสมควรจากภายในการบินไทยเอง ซึ่งให้เหตุผลว่าฝ่ายช่างและนักบินของการบินไทยมีความคุ้นเคยและชำนาญกับเครื่องของยีอีอยู่แล้ว การเปลี่ยนไปใช้เครื่องแพร็ต แอนด์ วิทนี่ย์ ต้องลงทุนในการฝึกอบรมและลงทุนเกี่ยวกับเครื่องมือซ่อมและบำรุงรักษาเครื่องยนต์ใหม่ ซึ่งต้องใช้เวลาและเงินจำนวนมาก

ยีอีนั้นมีความสัมพันธ์กับการบินไทยมาถึง 14 ปี ความสัมพันธ์นี้ยิ่งสนิทสนมแนบแน่นกับคนการบินไทยที่ต้องเกี่ยวข้องกับเรื่องเครื่องยนต์ด้วย เสียงคัดค้านจึงถูกมองไปในแง่ที่ว่า เกรงว่าการเปลี่ยนแปลงจะทำให้กระทบกระเทือนความสัมพันธ์ที่มีกับยีอี

วันที่ 6 กรกฎาคม คณะกรรมการการบินไทยมีมติให้ย้ายกัปตันชูศักดิ์ พาชัยยุทธ จาก ผู้อำนวยการใหญ่ฝ่ายช่างไปเป็นนักบินธรรมดาและให้เลื่อน นต.สำราญ พึ่งสุข รองผูอำนวยการใหญ่ฝ่ายช่างขึ้นดำรงตำแหน่งแทนด้วยเหตุผลว่า เพื่อโยกย้ายหมุนเวียนพนักงานระดับรองลงมาให้มีโอกาสดำรงตำแหน่งและรับเงินเดือนสูงขึ้น

กัปตันชูศักดิ์ในตำแหน่งผู้อำนวยการฝ่ายช่างมานานถึง 10 ปีแล้ว และรอดพ้นจากการถูกโยกย้ายครั้งใหญ่เมื่อเดือนตุลาคม 2531 ไปได้ถึงแม้ว่าจะถูกจัดกลุ่มให้อยู่ในกลุ่มอำนาจเก่าของการบินไทย มาคราวนี้เชื่อกันว่าสาเหตุของการถูกย้ายเพราะกัปตันชูศักดิ์คัดค้านความเห็นของคณะกรรมการที่ตัดสินใจเปลี่ยนเครื่องยนต์