แม้องค์ความรู้ว่าด้วยการแปลงน้ำมันพืชให้เป็นพลังงานด้วยกระบวนการ transesterification จะดำเนินมาตั้งแต่เมื่อครั้ง 2 นักวิทยาศาสตร์ นาม E.Duffy และ J.Patrick ทำการทดลองในห้องปฏิบัติการในช่วงปี 1853 หรือก่อนที่ Rudolf Diesel จะคิดค้นประดิษฐ์สร้างเครื่องยนต์ดีเซลเป็นเวลานานหลายปี

กระทั่ง G.Chavanne แห่งมหาวิทยาลัยบรัสเซลส์นำเสนอกระบวนการแปลงสภาพน้ำมันพืชให้เป็นเชื้อเพลิงด้วยการใช้เมทานอลและ/หรือเอทานอล เพื่อแยกกรดไขมันออกจาก glycerol ด้วยการแทนที่ glycerol ด้วยแอลกอฮอล์ดังกล่าว ได้รับการยอมรับให้จดสิทธิบัตรเมื่อปี 1937 เป็นการเริ่มต้นของการกำหนดนิยามและมาตรฐานในการผลิตไบโอดีเซลในปัจจุบัน